W 2000 r. Polskie Towarzystwo Ortodontyczne, jako pierwsza taka organizacja z krajów Europy Wschodniej zostało przyjęte do European Federation of Orthodontic Specialists Associations (EFOSA) - Europejskiej Federacji Specjalistów Ortodontów, a w 2005 po wejściu Polski do Unii Europejskiej stało się aktywnym członkiem EFOSA.
Towarzystwo jest też członkiem zrzeszonym w World Federation of Orthodontists (WFO) – Światowej Federacji Ortodontów, dzięki czemu członkowie PTO poprzez nasze Towarzystwo mogą wstąpić w szeregi tej organizacji.